Tata Nama Enzim

Advertisement
Prinsip Penamaan
Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya. Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim. Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.

Tata Nama
Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi atas enam kelas tergantung pada reaksi yang dikatalisis.
E.C.a.b.c.d
     a. Kelas enzim
     b. subkelas enzim
     c. Sub-sub kelas enzim
     d.Sub-sub-sub kelas enzim
Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak berdasarkan mekanisme reaksi

Klasifikasi Enzim
  1. Oksidoreduktase
  2. Transferase
  3. Hidrolase
  4. Liase
  5. Isomerase
  6. Ligase
 1.      Oksidoreduktase
Mengkatalisis transfer atom H, O atau elektron dari satu substrat ke yang lain.
Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron
ü  1. Alkohol
ü  2. Aldehid atau keton
ü  3. CH-CH
ü  4. Amin primer
ü  5. Amin sekunder
ü  6. NADH atau NADPH
Digit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron
ü  1. NAD+ atau NADP+
ü  2. Fe 3+
ü  3. O2
ü  99. Akseptor lain

Nama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase
        EC. 1.1.1.1
        Nama Sistematik: Alkohol:NAD+ oksidoreduktase
        Nama Trivial: Alkohol dehidrogenase
     (Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke akseptor selain O2)

2.      Transferase
         Katalisis transfer gugus fungsi khusus seperti metil, asil, amino, glikosil, atau fosfat dari satu senyawa ke senyawa lain.
            AX + B -------- BX + A
          Nama berakhiran X-Transferase, X adalah gugus yang ditransfer.
         Nama sistematik ditulis menurut: Donor:akseptor gugus transferase
      Digit kedua merupakan gugus yang ditransfer
     1. satu gugus karbon
     2. Gugus Aldehid atau keton
     3. Gugus Asil
     4. Gugus glikosil
     7. Gugus fosfat
      Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut gugus yang ditransfer
     E.C.2.1.1: metiltransferase
     E.C.2.1.2: hidroksimetiltransferase
     E.C.2.1.3: karboksil atau karbamoil transferase

3.      Hidrolase
         E.C.2.7.1: fosfotransferase dengan gugus alkohol sebagai akseptor
         E.C.2.7.2: Fosfotransferase dengan gugus karboksil sebagai akseptor
         E.C.2.7.3: fosfotransferase dengan gugus nitrogen sebagai akseptor
         Fosfotransferase mempunyai nama trivial dengan akhiran kinase
         Hidrolase
      Mengkatalisis reaksi hidrolis
A-X  + H2O  --------- X-OH  + HA

Digit kedua: Jenis ikatan yang dihidrolisis
      1. ester
      2. glikosidik
      4. peptida
      5. C-N selain peptida

Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut jenis ikatan yang dihidrolisis
      Nama substrat diberi akhiran –ase. Nama sistematik selalu mengikuti hidrolase.
         E.C.3.1.1. Ester karboksilat
         E.C.3.1.2. Ester tiol
         E.C.3.1.3 Monoester fosfat
         E.C.3.1.4 Diester fosfat

4.      Liase
      Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S.
      Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase.
       Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase, dehidratase (eliminasi CO2, aldehid, dan air).
      Digit kedua: ikatan yang diputus
     1. C-C
     2. C-O
     3. C-N
     4. C-S
      Digit ketiga: gugus yang dihilangkan. Untuk C-C liase
     1. gugus karboksil
     2. gugus aldehid
     3. gugus asam keto

5.      Isomerase
      Mengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul.
      Enzim diklasifikasikan menurut jenis reaksi yang terlibat.
      Digit kedua: Jenis Reaksi
ü  1. Rasemisasi atau epimerisasi
ü  2. Isomerisasi cis-trans
ü  3. Oksidoreduktase intramolekul
ü  4. Reaksi transfer intramolekul
      Digit Ketiga: jenis molekul yang mengalami isomerisasi
ü  1. asam amino
ü  2. asam hidroksi
ü  3. Karbohidrat

6.      Ligase
         Mengkatalisis pembentukan ikatan baru, disertai dengan hidrolisis ATP atau nukleosida trifosfat lainnya.
      X    +    Y    +  ATP -------------  X-Y  + ADP  + Pi
         Nama sistematik X:Y ligase
         Digit kedua: jenis ikatan yang dibentuk
ü  1. C-O
ü  2. C-S
ü  3. C-N
ü  4. C-C
         Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut ikatan yang dibentuk
         E.C. 6.3.1 asam-amonia ligase (amida, sintase)
         E.C. 6.3.2 asam-asam amino ligase (peptida, sintase)
         Contoh
      ATP + D-glukosa ------------------- ADP + D-glucose 6-phosphate
      Nama Sistematis: ATP:glucose phosphotransferase
      Nama yang Direkomendasi (trivial): Heksokinase
      EC number: 2.7.1.1
ü  (2) transferase
ü  (7) phosphotransferase
ü  (1) gugus hidroksil sebagai akseptor

ü  (1) nomor seri yang diberikan secara acak 

ARTIKEL YANG BERKAITAN